粤港澳大湾区精准医学研究院

GREATER BAY AREA INSTITUTE OF PRECISION MEDICINE

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精准医学大数据平台

发布日期:2021-06-01 15:53:50 作者: 来源:

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 平台名称:精准医学大数据平台

 所属中心:智能医学研究中心

 中心主任:杨忠

平台负责人:唐川

 联系方式:18670764388

    邮箱:tangchun@ipm-gba.org.cn 


(编者注:本页面内容更新于2024年9月)

 

【平台简介】

精准医学大数据平台秉承“服务科研、增效管理”的方针,基于“架构先进、安全合规、基础优质、成本合理”的原则建设,重点为研究院提供科研、管理、服务的信息化保障、满足科研数据治理和工程化生信分析的需求。

平台聚焦方向:

1.高性能计算:为科研团队提供高性能计算资源和平台服务,满足科研人员对复杂计算任务的需求。

2.科研数据治理:为科研团队提供完善的数据治理体系,规范的科研数据管理流程,提供安全、可靠、高效的数据管理环境,提升科研数据质量和可利用性。

3.工程化生信分析:为科研团队提供工程化生信分析工具和平台,标准化和定制化的数据分析服务,助力科研人员高效开展生物信息学研究。

 

【支撑团队】

精准医学大数据平台属于智能医学研究中心,现已建立50余人的团队,其中高级研究员1人,研究员1人,青年研究员3人,平台已具有生信工程师、数据工程师、人工智能工程师、专业领域博士等各类工程师不少于10+人的研发及服务团队。

唐川,高级工程师,粤港澳大湾区精准医学研究院网络信息办公室主任,精准医学大数据平台负责人,主要研究方向为网络空间安全、数据安全。获得国际信息系统审计协会注册信息系统审计师(ISACA CISA)、国家注册信息安全专业人员(CNITSEC CISP)资质认证。长期从事信息化、信息安全管理及相关技术研究工作,曾参研科研项目20余项,取得技术发明专利5项,发表学术论文20余篇,获省部级科技进步二等奖3项,荣立三等功一次。参与上海市市级重大专项国际人类表型组项目,从事数据平台、信息安全研究和数据安全标准化工作,参与编制国家数据安全标准4项,主导编制上海市生物信息学会团体标准1项。

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【硬件条件】

研究院精准医学大数据平台主要包括公有云和私有云构成的混合云算力基础设施。平台私有云建有模块化机房1套,其中设备已投入约600万元,建有高性能计算集群一套,拥有CPU核心总数964个,内存总量5.9TB,4块专业GPU加速卡计算卡(Nvidia A100),存储系统可用容量为1.3PB,达到网络安全等级保护三级要求,能够为院内外的用户提供一个可靠的、平衡的、高效的医学数据计算环境。平台公有云通过统一资源服务门户,可高效接入广州实验室Miracle-Cloud、国家超算广州中心、曙光智算等算力中心获取服务。

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【技术服务内容】

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【重要仪器设备】

1.HPC集群CPU计算节点

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2.HPC集群GPU计算节点

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3.HPC集群大内存计算节点

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4.HPC集群高性能存储

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【其他辅助设备】

计算网络,配置规格:InfiniBand,带宽200GB。

集群管理软件,配置:Slurm集群管理和作业调度系统;Lenovo LiCO HPC资源管理平台。

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